Непонятный отчет СКД

[Максим75]

sali, никаких предположений быть не может. Это конфигурация Ваша, и какая там логика - виднее тому, кто ее разрабатывал.
вот просто возьмите и посмотрите движения одного и второго документа и что пишется в СтруктурнаяЕдиница. Ни запросом, ни отчетом, а тупо на кнопку нажать Движения (или как там у Вас она может называться). Возможность то хоть реализована посмотреть движения документа в Вашей чудо конфигурации?
И вот когда увидите, что там пишется - тогда и дальше думать что и как. Если пишется и там и там в СтруктурнуюЕдиницу - значит бочина в запросе, а если в одном пишется, а в другом нет - то буквально по шагам проходите всю обработку проведения и смотрите, почему так.