Табличная часть в обычной форме

[mixqn]

По задаче ее надо запускать из табличной части документа.

ну так вы сначала отладьте, а потом запускайте откуда угодно.
конечно если в конфигураторе у вас открыт один файл, а в предприятии работает другой - точки останова работать не будут. надо одно и тоже открывать.